Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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