Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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