Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SP140Q13342 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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