Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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