Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HOXD10P28358 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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