Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRDP23468 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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