Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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FOXQ1Q9C009 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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