Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms