Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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