Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FXNQ16595 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.4 ms