Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CUL1Q13616 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CUL1Q13616 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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