Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TRAF1Q13077 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRAF1Q13077 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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