Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms