Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SALL3Q9BXA9 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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