Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms