Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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