Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms