Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RFTN1Q14699 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms