Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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