Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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