Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTPRBP23467 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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