Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD8P13378 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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