Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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