Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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