Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GOPCQ9HD26 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GOPCQ9HD26 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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