Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SMG9Q9H0W8 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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