Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms