Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
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COL24A1Q17RW2 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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COL24A1Q17RW2 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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COL24A1Q17RW2 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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COL24A1Q17RW2 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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COL24A1Q17RW2 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COL24A1Q17RW2 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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