Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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