Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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