Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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