Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms