Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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