Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms