Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF1Q12946 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXF1Q12946 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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