Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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