Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USF2Q15853 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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