Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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