Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms