Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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COL4A6Q14031 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL4A6Q14031 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL4A6Q14031 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
COL4A6Q14031 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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