| RUNX2 | Q13950 | AC026410.2-201 | ENST00000460281 | 156 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097493.1-201 | ENST00000463958 | 372 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P22-201 | ENST00000466005 | 733 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PABPC1P3-201 | ENST00000469174 | 459 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084117.1-201 | ENST00000496975 | 270 nt | TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108941.1-201 | ENST00000502853 | 530 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093297.2-204 | ENST00000508945 | 295 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02283-201 | ENST00000511634 | 474 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092542.1-201 | ENST00000513155 | 355 nt | TSL 2 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC10P-201 | ENST00000516967 | 122 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027801.4-201 | ENST00000518420 | 395 nt | TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084083.1-201 | ENST00000526947 | 722 nt | TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022367.1-202 | ENST00000535066 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV8-5-201 | ENST00000537369 | 341 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MFAP5-211 | ENST00000540087 | 492 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01467-201 | ENST00000554211 | 1187 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01584-202 | ENST00000563990 | 852 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DSCR9-205 | ENST00000585273 | 751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008759.1-201 | ENST00000589783 | 983 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC083899.3-201 | ENST00000603413 | 594 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LLPHP1-201 | ENST00000603571 | 367 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354984.3-201 | ENST00000604803 | 325 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00993-204 | ENST00000606476 | 500 nt | TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL021997.2-201 | ENST00000615674 | 271 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC243585.2-201 | ENST00000619099 | 508 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092683.2-201 | ENST00000619740 | 621 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354696.2-202 | ENST00000620300 | 613 nt | TSL 2 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244196.2-201 | ENST00000621184 | 411 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WASF3-AS1-206 | ENST00000626779 | 381 nt | TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099063.3-201 | ENST00000642066 | 185 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM208A-202 | ENST00000431842 | 7119 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136964.1-201 | ENST00000622038 | 2990 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCNYL2-202 | ENST00000637719 | 3311 nt | TSL 2 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01355-201 | ENST00000566551 | 5444 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGAP42-201 | ENST00000298815 | 4752 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARF4-206 | ENST00000489843 | 1360 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAD17-203 | ENST00000345306 | 2789 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002907.1-201 | ENST00000606361 | 1430 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C21orf91-201 | ENST00000284881 | 5433 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PMCHL2-201 | ENST00000415808 | 1841 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01239-202 | ENST00000436786 | 2347 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC17A3-204 | ENST00000397060 | 2052 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NRK-204 | ENST00000540278 | 1687 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF705D-202 | ENST00000400085 | 3377 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC126755.2-208 | ENST00000327792 | 462 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P132-201 | ENST00000331267 | 462 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138969.1-213 | ENST00000331436 | 462 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-374P-201 | ENST00000364146 | 108 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP175-201 | ENST00000364275 | 119 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.302-201 | ENST00000364997 | 102 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP22-201 | ENST00000365393 | 109 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1279P-201 | ENST00000383917 | 103 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DHFRP6-201 | ENST00000401776 | 268 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P17-201 | ENST00000403495 | 628 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-920P-201 | ENST00000410926 | 92 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117381.1-201 | ENST00000412972 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VN1R108P-201 | ENST00000431580 | 830 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BMS1P19-201 | ENST00000433925 | 393 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590103.1-201 | ENST00000434488 | 307 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP52-201 | ENST00000439311 | 478 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DIAPH2-AS1-202 | ENST00000445414 | 606 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPIAP3-201 | ENST00000450588 | 505 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589935.1-212 | ENST00000450998 | 525 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUN3-208 | ENST00000453192 | 801 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009963.2-201 | ENST00000453431 | 138 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022034.3-201 | ENST00000471393 | 478 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01327-201 | ENST00000498413 | 535 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LNX1-AS2-201 | ENST00000502410 | 347 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP43-201 | ENST00000513621 | 740 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-60P-201 | ENST00000517239 | 135 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBCA-206 | ENST00000518338 | 551 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAB9BP1-201 | ENST00000519581 | 626 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC120042.2-201 | ENST00000521556 | 667 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107373.1-201 | ENST00000522570 | 603 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CACNA1C-AS4-201 | ENST00000544415 | 735 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LYZ-203 | ENST00000549690 | 669 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMEM106C-220 | ENST00000552561 | 810 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007954.1-201 | ENST00000554198 | 494 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358333.1-201 | ENST00000555115 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P3-201 | ENST00000559254 | 309 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099313.1-201 | ENST00000568437 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009039.1-201 | ENST00000568711 | 471 nt | TSL 4 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC136618.2-201 | ENST00000575091 | 400 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007952.9-201 | ENST00000584365 | 191 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01533-202 | ENST00000588694 | 632 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157938.2-204 | ENST00000589667 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR7515HG-239 | ENST00000591053 | 1113 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02565-201 | ENST00000592678 | 478 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105129.3-201 | ENST00000605455 | 485 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2AS2P-201 | ENST00000606902 | 342 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513477.2-201 | ENST00000607858 | 568 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009237.17-201 | ENST00000618111 | 748 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC231657.1-201 | ENST00000624313 | 397 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079228.1-201 | ENST00000624774 | 1049 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092192.1-201 | ENST00000633154 | 1018 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRE11-202 | ENST00000323977 | 2588 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRL2-201 | ENST00000319517 | 5479 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DDX43P2-201 | ENST00000604753 | 1354 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPRC-201 | ENST00000348564 | 4626 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DMD-207 | ENST00000378677 | 13932 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |