Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
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