Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGB3BPQ13352 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms