Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SP140Q13342 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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