Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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