Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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