Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
EFEMP1Q12805 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms