Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms