Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HLA-DQB1P01920 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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