Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERVV-1B6SEH8 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms